El subwoofer no es tan crítico como otros altavoces. Realmente sólo proporciona frecuencias subgraves por lo que no tendrás problemas de integración timbrica con el resto de altavoces. Puedes poner cualquier modelo/marca sin problemas, siempre que te encaje en cuanto a estética y tamaño.
Respecto al tamaño, depende del espacio donde lo tengas ubicado (tamaño de sala). Yo tengo un 10" con muy buen rendimiento y voy sobrado, en una sala de 20m2. Normalmente los sub de 12" son complejos de ubicar por su tamaño de recinto, y eso para las WAT es "pecadooo", pero en cuanto a prestaciones son mejor opción.