Con este tipo de sistema 2.1 lo que se suele hacer es conectar el ordenador al sub como estéreo 2.0:
1- cable con el tipo de conector que tengas como salida en el ordenador en un extremo (OUT) y en el otro o una RCA (IN) o dos RCA (IN)(dependiendo de si la salida 2.0 es estéreo o hay una para cada canal)
1a- Si hay una para cada canal son dos cables separados jack mono o RCA (al OUT del ordenador) - RCA (al IN del sub).... un cable así para cada canal
1b- Si hay una para los dos canales a la vez será un jack estéreo (luego te haría falta un cable jack 3.5 típicos en forma de "Y" con doble RCA)
2- Una vez has entrado el audio del ordenador al sub; éste es el que se encarga de recortar por arriba a sí mismo (para eso vale esa ruedecita LOW PASS que comentas), e internamente corta su salida out vía RCA a 100hz (para que salgas de cada una de las RCA out de los dos canales con el cable en forma de "Y" que te comenté ayer con el otro extremo en jack 3.5mm... jack que conectarás en la entrada de jack de la Woxter que lleva el amplificador)
Un saludete
P.D.: Lo de la ganancia necesaria es un tema de que llegue o no suficiente señal para aprovechar (o no) la potencia del amplificador al máximo sin saturar), que EMHO mejor no entrar en detalles para no liarte más. Si realizas las conexiones que te comento todo debería ir perfecto (el resto ya será ajustarlo)