Actualizo:

Sigo con el problema. He probado a resetear de fábrica, he quitado todas las conexiones de altavoces, he limpiado, y vuelta a conectar. Sigo con el problema pero lo he acotado.

El sonido clack clack sigue siendo bastante aleatorio pero he encontrado cuando desaparece el audio. Es cuando, cualquiera de las entradas la pongo en stereo o modo directo. Es decir, lo que dejan de sonar son los altavoces frontales Klipch. Se va el audio y al cabo de un buen rato, puede volver solo, sin tocar nada.

Voy a seguir investigando, no se por donde coger esto.