En el Yamaha pon una frecuencia de corte de 80 Hz.
En el subwoofer, pon 80 Hz y un poco en LOW FRECUENCY.
Si tus altavoces no bajan hasta 80 Hz y son pequeños, mira en las instrucciones hasta que frecuencia llegan y lo que decíamos de 80 aplícalo a esa frecuencia + 10 o 20 Hz. Lo que la configuración de tu Yamaha en el manual indique como posible.
Un saludo.