Hola WilliamDJ,
En cuanto a las APUs, ya te comentaba que en esa caja sin problema alguno puedes poner una de 54w y si la refrigeración es de calidad decente tendrás total silencio; por supuesto, si quieres puedes poner el 4130T de 35w que en cargas medias y altas consume menos, con lo que sera aún más fácil refrigerarlo. Cualquiera de estas opciones es buena.
En cuanto al sonido, si vas a sacarlo por HDMI o incluso por SPDIF no necesitas tarjeta de sonido aparte, pues lo ideal es sacarlo por passthrought y que el AV sea el que los decodifique, de forma que el HTPC no influye para nada en la calidad final (pues pasa la señal en digital).
En cambio si quieres sacar en analógico, ahí ya si que tienes margen de mejora con respecto a la integrada en placa base, podrías o bien buscar una placa base con una integrada que tenga una relación de ruido menor, con más calidad, o bien poner una tarjeta de sonido dedicada.
En caso de poner una dedicada, no hace falta una de gama alta, con una Xonar DG o DGX ya tendrás buena calidad, imagino que al usar una placa ITX tendrás un solo slot de expansión que será PCI-Express, con lo que tendrás que poner la DGX: ENLACE
Saludos